Rund 526 ha (64,1%) des Gemeindegebiets (TIROL ATLAS) sind bewaldet. Gemäß Waldentwicklungsplan gibt es im Gemeindegebiet Wald mit Schutzfunktion, mit Nutzfunktion sowie in geringem Ausmaß auch mit Wohlfahrtsfunktion.
Im Raum des Siedlungsgebietes von Kauns spielt der Wald eine eher untergeordnete Rolle, die nicht bebauten Flächen bestehen hier zumeist aus Wiesen. Im östlichen Teil des Gemeindegebietes nimmt der Wald hingegen eine dominante Rolle im Erscheinungsbild ein. Er besteht dabei zu einem Großteil aus Fichten.
Das Kaunertal wird durch die Fagge entwässert, die sich im westlichen Teil des Gemeindegebietes tief in das Gelände eingekerbt hat. Im östlichen Bereich weitet sich das Tal etwas auf. Die Durchflussschwankungen und Geschiebeführungen der Fagge sind durch den Gepatsch-Stausee stark verändert. Im Gemeindegebiet von Kauns ist ihr Verlauf jedoch natürlich, die Ufer sind nur teilweise verbaut.
Neben der Fagge sind folgende fließende Gewässer im Kauner Gemeindegebiet zu nennen:
• Abgesehen von der Fagge stellt der Petersbach das bedeutendste Gewässer des Gemeindegebiets dar und durchfließt das Gemeindegebiet südlich der Fagge von Süden in Richtung Norden. Der Petersbach entspringt an den nordorientierten Abhängen des Glockturmkammes (Ochsenkopf) und mündet im östlichen Gemeindegebiet von Kauns in die Fagge.
• Das Gemeindegebiet nördlich der Fagge wird hauptsächlich durch den Prantacher Mühlbach sowie dem Schlossbach entwässert, die östlich des Hauptsiedlungsgebietes in die Fagge münden.
• Die landwirtschaftlichen Nutzflächen im nordöstlichen Teil des Gemeindegebietes werden durch ein künstliches Bewässerungssystem mit Wasser versorgt, das großteils unterirdisch verläuft.
Im Ortskern von Kauns, gegenüber der Volksschule erstreckt sich ein alter Löschteich, der eine standortgerechte Ufervegetation aufweist. Neben seiner Funktion als ökologische Ausgleichsfläche im verbauten Gebiet prägt das offene Gewässer auch wesentlich das Ortsbild von Kauns.
Oberhalb der Landesstraße nach Kaunerberg befindet sich ein ehemaliger Speicherteich, der für Bewässerungszwecke genutzt wurde. Heute ist das Gewässer nahezu zur Gänze verlandet.
Gemäß Gefahrenzonenplan der Gemeinde Kauns ist eine Gefährdung des Siedlungsgebietes lediglich durch Wildbachereignisse gegeben (vgl. dazu folgende Abbildung).
Betroffen davon sind der westliche Teil von Floar, der westliche Teil des Dorfzentrums sowie das Außer- und das Unterdorf.